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单细胞表达相关分析法表征发育组织的基因表达图谱—小柯机器人—科学网

作者:habao 来源: 日期:2019-8-4 4:48:02 人气: 标签:相关分析

  癌症研究中心(DKFZ)Aurelio A. Teleman和Michael Boutros小组宣布,用单细胞表达相关分析法分析了发育组织的基因表达图谱。相关论文于2019年8月2日发表于国际学术期刊《自然方》上。梦见钱包丢了

  为了获得翼盘的基因表达图谱,研究团队采用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq),开发了一种基于基因表达相关性而不是细胞图谱分析scRNA-seq数据的方法。从而能够计算翼盘中所有检测到的基因的表达图谱,并发现具有空间表达模式的824个基因。该方法可以用来鉴定具有相似表达模式和功能相关性的基因簇。作为概念的证明,研究人员描述了之前未研究的基因CG5151的特征,并表明它调控Wnt信号。新的方法能够利用scna -seq数据在发育过程中生成未分化组织的表达图谱。

  据了解,果蝇翼盘是发现关键信号通和理解发育过程的基本模型系统。然而,该组织中基因表达的完整图谱仍然缺乏。

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